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據史書記載是如下:
洪武八年（1375年），劉基不良於行，但仍和京官參加元旦的早朝，隨後在奉天殿做了一首《乙卯歲早朝》，這雖屬於歌功頒德的應酬文字，但詩中仍可以看見劉基的心情。正月中旬，宋濂的門人劉剛來到劉基的住處，商請劉伯溫將宋濂的百餘卷作品，摘選並編輯成書，又請劉基為之序。正月下旬，劉基偶感風寒，朱元璋派胡惟庸帶御醫去探望。御醫開了藥方，服罷，覺腹中似有積物，讓他十分痛苦。
二月中，劉基抱病覲見朱元璋，婉轉地向他稟告胡惟庸帶著御醫來探病，以及服食御醫所開的藥之後更加不適的情形。朱元璋只是講些安慰話，這使劉基相當的心寒。三月下旬，病情惡化，由劉璉陪伴，在朱元璋的特遣人員的護送下，自京師動身返鄉。回家以後，即拒絕服藥，只正常飲食。

有說是因為淮西派的胡惟庸故意在藥中下毒,以至於劉基在病發前就死亡了,也有說朱元璋知道胡惟庸與劉伯溫主導的浙東派結怨已久,故意藉胡惟庸之手除掉劉伯溫,再以擅自毒害大臣為由,賜死胡惟庸,而藉著胡惟庸一人,將其開國功臣數十位牽連在內的數萬人都逮捕殺頭,以朱元璋手段之狠,比漢高祖劉邦建國後殺光功臣的手法還要殘酷無情,各位大大覺得呢?