國民黨中常委邱毅11日在中常會建議應該刪除高中曆史教科書中皇民化、“台獨”化等不宜的內容，台灣與中國史應合並稱爲“本國史”，獲馬英九認同，馬英九認爲這是符合“憲法”的既定“國策”。馬英九表示，他辦公桌上現正放著壹叠即將出版的高中曆史教科書，他看了也覺得很荒謬，內容嚴重違反“憲法”。
據香港中評社報道，這是馬英九對爭議多時的高中曆史教科書內容最明確的宣示。
馬英九強調，他第壹任的時候許多高中曆史教科書課綱委員、審定委員都是前朝的，任期沒到也不能換，所以他已責成“教育部”盡快處理這個問題，有關內容違反“憲法”的壹些“台獨”化、皇民化的內容，應該要刪除；台灣史、中國史應該要合並爲“本國史”，因爲這是符合“憲法”的既定“國策”。
邱毅在11日的中常會建議兩件事，壹是教學順序應該改過來，先教中國史再教台灣史，現在是先台灣後中國；二是要更進壹步做到台灣史與中國史合並爲“本國史”。
馬英九的回應非常具體、明白，而且強烈表示會積極處理，改正內容。他說，他的辦公桌上放著壹叠即將出版的高中曆史教科書，看了也覺得很荒謬，例如屏東的慰安婦阿桃當初明明是被強拉去當慰安婦而非自願。清朝統治寫成清領（清朝占領），把清朝、鄭成功、國民黨執政與日本統治都視爲外來政權等；不僅內容錯誤，更嚴重的是違反“憲法”。
邱毅表示，從李登輝到陳水扁以來，甚至馬英九第壹任4年來的幾任“教育部長”，高中曆史教科書內容都還是維持扁朝“教育部長”杜正勝當年的同心圓史觀，就是先台灣史、才是世界史、中國史，造成台灣的新世代認爲“壹邊壹國”，“台灣是台灣，中國是中國”。
邱毅指出，教科書內容不但失去了淵遠流長的曆史感，也失去話語權，日軍強征台灣婦女當慰安婦，居然講成自願、肯定的態度，日軍占領台灣稱爲日治時期，教科書內容充滿皇民化與“台獨”化的思想。
