《荷據時期》 鄭芝龍霸業之道
一六二五年十二月二日，楊天生集諸位商議，再推一人統眾方可。眾推鄭芝龍為首，繼統其業。鄭芝龍一就任，銳不可擋。鄭氏集團以仁、義、禮、智、信為名的五大流通體系，將海上霸權擴及大明內陸的浙江、江蘇、江西、安徽、湖南、湖北、河南、山西、陝西、河北、甘肅等地，同時商船團以金、木、水、火、土五大船團行駛於中國、日本、朝鮮、琉球、台灣、菲律賓、中南半島諸國，南至巴達維亞。令旗費依船隻大小，有高達2000兩黃金者，創造年收入高達400萬兩黃金的龐大事業。
在明廷方面，兵將互相爭功諉過，鄭芝龍在明朝政府中的官位低，又沒有主動出面邀功，但他攻擊荷蘭軍艦，打破荷軍在海上的絕對優勢，功勞無出其右，但明廷非但未加表揚，竟仍以海盜視之，引起鄭芝龍憤怒，並欲出兵伐明。
鄭芝龍逮住一次機會，截住暹羅國向明廷的進貢船，成功得手，致富甲十寨。一六二七年(天啟七年)，更集結海上兵艦進攻大明的漳浦，明軍無法抵擋，遂據佔廈門。一時明廷亦無可奈何，明軍知道上次澎湖收復戰全賴鄭軍之力，無可抗衡。而鄭軍威名震動南海，無術可制。
一六二八年(崇禎元年)，鄭軍實力與日俱增，從福建漳州出發的四十三艘戎克船之中，被鄭芝龍劫去二十餘艘。明廷一方面施行海禁，壓制善良大眾，無視討海人生計，另一方面再度對鄭芝龍加以招撫，並提出鄭芝龍無法抗拒的有利條件，即承認鄭軍攻荷有功，並授權與鄭芝龍負責掃盪橫行在台灣海峽的海盜，這項原本是十分困擾的工作，對鄭芝龍而言卻是大大的利多。因他可藉此掃除敵對的同業。
鄭芝龍也感到多年來棲身海外，終非善策，若有正式官銜，從黑道轉成白道，何樂不為，所以也有歸順之意，終於有第二次正式投降明廷。明廷也樂於接受，另一原因是鄭軍是鄭芝龍的私人軍隊，不需政府的預算、資金來供養。鄭芝龍方面藉著官銜及自己的武力，以公報私仇也好，或公事公辦也行，消滅了李魁奇、劉香老等後起的競爭者，順理成章、名附其實成為台灣海峽及南海的最大海上勢力。是時，海舶不論中外不得鄭氏令旗不能往來，聲勢之浩大由此可知。令旗者海上保險也。
